JindoRuntime来源于阿里云EMR团队JindoFS,是基于C++实现的支撑Dataset数据管理和缓存的执行引擎,支持OSS对象存储。JindoFS是阿里云的产品,有专门的产品级支持。Fluid通过管理和调度JindoRuntime实现数据集的可见性、弹性伸缩和数据迁移。本文介绍JindoFS如何加速OSS文件访问。
前提条件
已创建一个非ContainerOS操作系统的ACK Pro版集群,且集群版本为1.18及以上。具体操作,请参见创建ACK Pro版集群。
重要ack-fluid组件暂不支持在ContainerOS操作系统上使用。
已安装云原生AI套件并部署ack-fluid组件。
重要若您已安装开源Fluid,请卸载后再部署ack-fluid组件。
已通过kubectl连接Kubernetes集群。具体操作,请参见通过kubectl工具连接集群。
已开通阿里云对象存储(OSS)服务。具体操作,请参见开通OSS服务。
背景信息
准备好K8s和OSS环境的条件后,您只需要耗费10分钟左右即可完成JindoRuntime环境的部署。
步骤一:准备OSS Bucket的数据
执行以下命令,下载测试数据到ECS实例中。
wget https://archive.apache.org/dist/spark/spark-3.0.1/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz
将下载的测试数据上传到阿里云OSS对应的Bucket中。
重要上传到OSS的步骤以Alibaba Cloud Linux 3.2104 LTS 64位的ECS实例为例。其他操作系统的具体操作,请参见命令行工具ossutil命令参考和ossutil概述。
创建名称为
examplebucket
的存储空间。输入以下命令创建
examplebucket
。ossutil64 mb oss://examplebucket
以下输出结果表明已成功创建
examplebucket
。0.668238(s) elapsed
将下载的测试数据上传到新建的
examplebucket
中。ossutil64 cp spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz oss://examplebucket
步骤二:创建Dataset和JindoRuntime
在创建Dataset之前,在ECS实例中的根目录中创建一个
mySecret.yaml
文件。apiVersion: v1 kind: Secret metadata: name: mysecret stringData: fs.oss.accessKeyId: xxx fs.oss.accessKeySecret: xxx
其中,
fs.oss.accessKeyId
和fs.oss.accessKeySecret
是步骤一中用来访问OSS的AccessKey ID
和AccessKey Secret
。执行以下命令,生成Secret。K8s会对已创建的Secret使用加密编码,避免将其明文暴露。
kubectl create -f mySecret.yaml
使用以下YAML文件样例创建一个名为
resource.yaml
的文件,里面包含两部分:创建一个Dataset,描述远端存储数据集和UFS的信息。
创建一个JindoRuntime,启动一个JindoFS的集群来提供缓存服务。
apiVersion: data.fluid.io/v1alpha1 kind: Dataset metadata: name: hadoop spec: mounts: - mountPoint: oss://<oss_bucket>/<bucket_dir> options: fs.oss.endpoint: <oss_endpoint> name: hadoop path: "/" encryptOptions: - name: fs.oss.accessKeyId valueFrom: secretKeyRef: name: mysecret key: fs.oss.accessKeyId - name: fs.oss.accessKeySecret valueFrom: secretKeyRef: name: mysecret key: fs.oss.accessKeySecret --- apiVersion: data.fluid.io/v1alpha1 kind: JindoRuntime metadata: name: hadoop spec: replicas: 2 tieredstore: levels: - mediumtype: MEM path: /dev/shm volumeType: emptyDir quota: 2Gi high: "0.99" low: "0.95"
相关参数解释如下表所示:
参数
说明
mountPoint
oss://<oss_bucket>/<bucket_dir>表示挂载UFS的路径,路径中不需要包含endpoint信息。
fs.oss.endpoint
OSS Bucket的Endpoint信息,公网或私网地址均支持。更多信息,请参见访问域名和数据中心。
replicas
表示创建JindoFS集群的Worker数量。
mediumtype
表示缓存类型。在创建JindoRuntime模板样例时,JindoFS暂时只支持HDD/SSD/MEM中的其中一种缓存类型。
path
表示存储路径,暂时只支持单个路径。当选择MEM做缓存时,需指定一个本地路径来存储Log等文件。
quota
表示缓存最大容量,单位GB。
high
表示存储容量上限大小。
low
表示存储容量下限大小。
执行以下命令,创建JindoRuntime和Dataset。
kubectl create -f resource.yaml
执行以下命令,查看Dataset的部署情况。
kubectl get dataset hadoop
预期输出:
NAME UFS TOTAL SIZE CACHED CACHE CAPACITY CACHED PERCENTAGE PHASE AGE hadoop 210MiB 0.00B 4.00GiB 0.0% Bound 1h
执行以下命令,查看JindoRuntime的部署情况。
kubectl get jindoruntime hadoop
预期输出:
NAME MASTER PHASE WORKER PHASE FUSE PHASE AGE hadoop Ready Ready Ready 4m45s
执行以下命令,查看PV和PVC的创建情况。
kubectl get pv,pvc
预期输出:
NAME CAPACITY ACCESS MODES RECLAIM POLICY STATUS CLAIM STORAGECLASS REASON AGE persistentvolume/hadoop 100Gi RWX Retain Bound default/hadoop 52m NAME STATUS VOLUME CAPACITY ACCESS MODES STORAGECLASS AGE persistentvolumeclaim/hadoop Bound hadoop 100Gi RWX 52m
从上述输出的查询信息,可以知道Dataset和JindoRuntime已创建成功。
步骤三:创建应用容器体验加速效果
您可以通过创建应用容器来使用JindoFS加速服务,或者提交机器学习作业来体验相关功能。本文以创建一个应用容器多次访问同一数据,并通过比较访问时间来展示JindoRuntime的加速效果。
使用以下YAML文件样例,创建名为app.yaml 的文件。
apiVersion: v1 kind: Pod metadata: name: demo-app spec: containers: - name: demo image: anolis-registry.cn-zhangjiakou.cr.aliyuncs.com/openanolis/nginx:1.14.1-8.6 volumeMounts: - mountPath: /data name: hadoop volumes: - name: hadoop persistentVolumeClaim: claimName: hadoop
执行以下命令,创建应用容器。
kubectl create -f app.yaml
执行以下命令,查看文件大小。
kubectl exec -it demo-app -- bash du -sh /data/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz
预期输出:
210M /data/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz
执行如下命令,查看文件的拷贝时间。
time cp /data/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz /dev/null
预期输出:
real 0m18.386s user 0m0.002s sys 0m0.105s
从上述输出信息,可以知道文件拷贝时间消耗了18s。
执行以下命令,查看此时Dataset的缓存情况。
kubectl get dataset hadoop
预期输出:
NAME UFS TOTAL SIZE CACHED CACHE CAPACITY CACHED PERCENTAGE PHASE AGE hadoop 210.00MiB 210.00MiB 4.00GiB 100.0% Bound 1h
从上述输出信息,可以知道210 MiB的数据已经都缓存到了本地。
执行以下命令,删除之前的应用容器,新建相同的应用容器。
说明这样做的目的是为了避免其他因素(例如:Page Cache)对结果造成影响。
kubectl delete -f app.yaml && kubectl create -f app.yaml
执行如下命令,查看文件拷贝时间。
kubectl exec -it demo-app -- bash time cp /data/spark-3.0.1-bin-hadoop2.7.tgz /dev/null
预期输出:
real 0m0.048s user 0m0.001s sys 0m0.046s
从上述输出信息,可以知道进行文件的cp拷贝观察时间消耗48 ms,整个拷贝的时间缩短了300多倍。
说明由于文件已经被JindoFS缓存,第二次访问所需时间远小于第一次。
环境清理
当您不再使用该数据加速功能时,需要清理环境。
执行以下命令,删除应用容器。
kubectl delete pod demo-app
执行以下命令,删除Dataset和JindoRuntime。
kubectl delete dataset hadoop