ApsaraDB for MongoDBインスタンスのディスクのデフラグメント - ApsaraDB for MongoDB

ApsaraDB for MongoDBインスタンスからデータが削除されると、削除されたデータによって使用されるストレージは空きストレージスペースとしてマークされます。新たに書き込まれたデータは、フリーストレージに直接格納されてもよいし、ファイルのストレージが拡張された後にファイルの最後に格納されてもよい。その結果、空きストレージの一部は使用されない。このような未使用のフリーストレージはディスクフラグメントを構成します。ディスクフラグメントが増えると、ディスク使用率が低下します。

ストレージ分析機能を使用して、ApsaraDB for MongoDBインスタンスのディスクを最適化できます。この機能を使用して、インスタンスのストレージの概要、ストレージの傾向、例外、およびデータスペースを表示することもできます。詳細については、「スペース分析」をご参照ください。

前提条件

インスタンスのストレージエンジンは WiredTiger。

背景情報

db.ru nCommand({collStats: <collection_name>}) コマンドを実行してノードにアクセスすると、sizeとstorageSizeというキーワードが返されます。 sizeは、コレクションの論理ストレージサイズを示します。 storageSizeは、コレクションの物理ストレージサイズを示します。 removeコマンドを実行してドキュメントを削除すると、sizeの値は小さくなりますが、storageSizeの値は必ずしも小さくなりません。 storageSize値がsize値より大きい場合、ディスクフラグメントが生成されます。

説明

MongoDB 4.4以降を実行するApsaraDB For MongoDBインスタンスの場合、結果でfreeStorageSizeキーワードを使用して、アイドル状態でディスクフラグメントで再利用できるディスク容量を表示することもできます。
size、storageSize、およびfreeStorageSizeキーワードの詳細については、「collStats-Output」をご参照ください。

compactコマンドは、ApsaraDB for MongoDBでデータの最適化に使用できます。 compactコマンドを実行して、データの削除後に生成されたディスクフラグメントを再利用し、ディスクの使用率を高めることができます。 compactコマンドの詳細については、「compact」をご参照ください。

使用上の注意

ApsaraDB for MongoDBのディスクを最適化する前に、まずデータをバックアップすることをお勧めします。インスタンスのデータをバックアップする方法の詳細については、「ApsaraDB For MongoDBインスタンスのデータを手動でバックアップする」をご参照ください。
MongoDB 4.4より前のバージョンを実行しているApsaraDB for MongoDBインスタンスのコレクションでcompactコマンドを実行すると、コレクションが属するデータベースがロックされ、データベースで実行される読み取り /書き込み操作がブロックされます。オフピーク時にコマンドを実行することを推奨します。詳細については、「compact」をご参照ください。
説明
compactコマンドを実行してインスタンスのディスクをデフラグするのに必要な時間は、収集データの量やシステム負荷などの要因によって異なります。
MongoDB 3.4.x、MongoDB 4.0.x、MongoDB 4.0.22以前、またはMongoDB 5.0.6以前を実行しているインスタンスでcompactコマンドが実行されているノードがRECOVERING状態になります。ノードが長期間この状態のままである場合、そのノードは、インスタンス検出コンポーネントによって異常なノードとして識別されます。これにより、再構築操作がトリガーされます。前のバージョンより後のバージョンのMongoDBを実行するインスタンスでは、compactコマンドが実行されているノードはSECONDARY状態のままです。これは再構築操作をトリガーしません。詳細については、「MongoDBドキュメント」をご参照ください。 MongoDBのバージョンの詳細については、「ApsaraDB For MongoDBのマイナーバージョンのリリースノート」をご参照ください。
以下のシナリオでは、compactコマンドを実行できません。詳細については、「オープンソースコード」をご参照ください。
- 物理コレクションのサイズは1 MB未満です。
- ファイルストレージの最初の80% のうち、空きストレージは20% 未満です。ファイルストレージの最初の90% のうち、空きストレージは10% 未満です。
compactコマンドが実行されている場合、ApsaraDB for MongoDBインスタンスのリリースされたストレージが空きストレージよりも小さい可能性があります。この場合、compactコマンドを繰り返し実行して、インスタンスのディスクを最適化できます。ただし、compactコマンドを高頻度で実行しないことをお勧めします。
compactコマンドは、ディスク容量がフルになったためにApsaraDB for MongoDBインスタンスがロックされている場合に実行できます。

再利用するディスク容量の見積もり

mongo shellを使用して、ApsaraDB for MongoDBインスタンスに接続します。接続方法は、インスタンスアーキテクチャによって異なります。詳細については、以下のトピックを参照してください。
指定したコレクションが格納されているデータベースに切り替えます。
構文：
```
use <database_name>
```
次のコマンドのパラメーター: <database_name>: コレクションが属するデータベースの名前。
説明
show dbsコマンドを実行して、現在のデータベースの名前を照会できます。
例：
test_databaseデータベースに切り替えます。
```
use test_database
```
コレクション用に再利用されるディスク領域を表示します。
構文：
```
db.<collection_name>.stats().wiredTiger["block-manager"]["file bytes available for reuse"]
```
次のコマンドのパラメーター: <collection_name> コレクションの名前。
説明
show tablesコマンドを実行して、現在のコレクションの名前を照会できます。
例：
```
db.test_database_collection.stats().wiredTiger["block-manager"]["file bytes available for reuse"]
```
次の結果が返されます。
```
207806464
```
この結果は、回収する推定ディスク容量が207,806,464バイトであることを示しています。

スタンドアロンまたはレプリカセットインスタンスのディスクのデフラグメント

スタンドアロンインスタンスのノードは 1 つです。プライマリノードに接続し、compactコマンドを実行してプライマリノードのディスクを最適化できます。
レプリカセットインスタンスには複数のノードがあります。プライマリノードとセカンダリノードに接続する必要があります。別のノードでcompactコマンドを実行して、ノードのディスクを最適化します。
説明
レプリカセットインスタンスに読み取り専用ノードがある場合、プライマリノードとセカンダリノードのディスクをデフラグする方法と同様の方法を使用して、読み取り専用ノードのディスクをデフラグする必要があります。

mongo shellを使用して、スタンドアロンまたはレプリカセットインスタンスに接続します。接続方法は、インスタンスアーキテクチャによって異なります。詳細については、以下のトピックを参照してください。
- mongo shellを使用したスタンドアロンApsaraDB for MongoDBインスタンスへの接続
- mongoシェルを使用したレプリカセットインスタンスへの接続
指定されたコレクションが格納されているデータベースに切り替えます。
構文：
```
use <database_name>
```
次のコマンドのパラメーター: <database_name>: コレクションが属するデータベースの名前。
説明
show dbsコマンドを実行して、現在のデータベースの名前を照会できます。
例：
replica_databaseデータベースに切り替えます。
```
use replica_database
```
デフラグ前にデータベースが占有しているディスク容量を表示します。
```
db.stats()
```
説明
このコマンドは変更なしで使用できます。
コレクションのディスクをデフラグメントします。
構文：
```
db.runCommand({compact:"<collection_name>",force:true})
```
上記のコマンドのパラメータ:
- <collection_name>: コレクションの名前。
  説明
  show tablesコマンドを実行して、現在のコレクションの名前を照会できます。
- force: オプション。値を true に設定します。
  このパラメーターは、MongoDB 4.2以前を実行するApsaraDB for MongoDBインスタンスのプライマリノードでコマンドを実行する場合に必要です。
例：
```
db.runCommand({compact:"sharded_collection"})
```
次の応答が返されます。
```
{ "ok" : 1 }
```
デフラグ後にデータベースが占有しているディスク容量を表示します。
```
db.stats()
```
説明
このコマンドは変更なしで使用できます。

シャードクラスタインスタンスのディスクのデフラグメント

シャードクラスターインスタンスの場合、シャードコンポーネントのディスクを最適化するだけで済みます。インスタンス内のmongosおよびConfigServerコンポーネントは、ユーザーデータを保存しません。加えて、より多くの追加および更新動作およびより少ない削除動作が実行されます。したがって、mongosおよびConfigServerコンポーネントのディスクを最適化する必要はありません。

説明

compactコマンドは、シャードクラスタインスタンスの読み取り専用ノードではサポートされていません。したがって、読み取り専用ノードのディスクはデフラグできません。

mongoシェルを使用してシャードクラスターインスタンスに接続します。詳細については、「mongo shellを使用したシャードクラスターApsaraDB For MongoDBインスタンスへの接続」をご参照ください。
指定したコレクションが格納されているデータベースに切り替えます。
構文：
```
use <database_name>
```
上記のコマンドのパラメーター: <database_name>: コレクションが属するデータベースの名前。
説明
show dbsコマンドを実行して、現在のデータベースの名前を照会できます。
例：
sharded_databaseデータベースに切り替えます。
```
use sharded_database
```
デフラグ前にデータベースが占有しているディスク容量を表示します。
```
db.stats()
```
説明
このコマンドは変更なしで使用できます。
コレクションのディスクをデフラグメントします。
シャードコンポーネントのプライマリノードとセカンダリノードのディスクを最適化する必要があります。
- シャードコンポーネントのプライマリノードのディスクをデフラグメントします。
  構文：
```
db.runCommand({runCommandOnShard:"<Shard ID>","command":{compact:"<collection_name>",force:true}})
```
  上記のコマンドのパラメータ:
  - <Shard ID>: シャードコンポーネントのID。
    説明
    ApsaraDB for MongoDBコンソールにログインし、[基本情報] ページの [シャードリスト] セクションでシャードコンポーネントのIDを表示できます。
  - <collection_name>: コレクションの名前。
    説明
    show tablesコマンドを実行して、現在のコレクションの名前を照会できます。
  - force: オプション。値を true に設定します。
    このパラメーターは、MongoDB 4.2以前を実行するシャードクラスターインスタンスでコマンドを実行する場合に必要です。
  例：
```
db.runCommand({runCommandOnShard:"shard01","command":{compact:"sharded_collection",force:true}})
```
- シャードコンポーネント内のセカンダリノードのディスクをデフラグメントします。
  この操作は、mongoshとは異なる方法でmongo shellで実行されます。クライアントに合った操作を選択します。
  モンゴシェル
  構文：
  db.runCommand({runCommandOnShard:"<Shard ID>","command":{compact:"<collection_name>"},$queryOptions: {$readPreference: {mode: 'secondary'}}})
  上記のコマンドのパラメータ:
  <Shard ID>: シャードコンポーネントのID。
  説明
  ApsaraDB for MongoDBコンソールにログインし、[基本情報] ページの [シャードリスト] セクションでシャードコンポーネントのIDを表示できます。
  <collection_name>: コレクションの名前。
  説明
  show tablesコマンドを実行して、現在のコレクションの名前を照会できます。
  例：
  db.runCommand({runCommandOnShard:"shard01","command":{compact:"sharded_collection"},$queryOptions: {$readPreference: {mode: 'secondary'}}})
  モンゴッシュ
  説明
  runCommandOnShardコマンドは、v2.xのmongoshではサポートされていません。このコマンドをmongosh v1.xで実行します。
  構文：
  db.getMongo().setReadPref('secondary') db.runCommand({runCommandOnShard:"<Shard ID>","command":{compact:"<collection_name>"}})
  上記のコマンドのパラメータ:
  <Shard ID>: シャードコンポーネントのID。
  説明
  ApsaraDB for MongoDBコンソールにログインし、[基本情報] ページの [シャードリスト] セクションでシャードコンポーネントのIDを表示できます。
  <collection_name>: コレクションの名前。
  説明
  show tablesコマンドを実行して、現在のコレクションの名前を照会できます。
  例：
  db.getMongo().setReadPref('secondary') db.runCommand({runCommandOnShard:"d-2ze91ae9d55d6604","command":{compact:"test"}})
デフラグ後にデータベースが占有しているディスク容量を表示します。
```
db.stats()
```
説明
このコマンドは変更なしで使用できます。