개요
Elastic HPC(High Performance Computing) 기술은 전 세계적으로 발생한 신종 코로나바이러스 감염증(COVID-19)에 맞서 전 세계 연구원들의 의약품 및 백신 개발과 공공 보건 개선 작업을 가속화하는 데 사용할 수 있습니다.
지금까지 이 기술은 AI 기반 의약품 설계, CT 영상 진단, 생물 정보학 메타전사체와 같은 솔루션으로 COVID-19에 대한 연구를 실시하는 약 20개의 연구 그룹을 지원해 왔습니다. 칭화대학에서 개발한 COVID-19 폐렴 관련 지능형 CT 진단 시스템을 사용하면 의심 사례에 대한 진단을 10초 내에 완료할 수 있습니다. 생물 정보학 데이터 세트 전송 속도는 5배 빨라졌으며, 중산대학의 유전자 조립 성능은 25% 빨라졌습니다. Jingtai 기술은 1개월 이상 소요되던 의약품 가상 스크리닝 시간을 1주로 단축하여 약물 체외 검사 프로세스를 대폭 가속화했습니다.
E-HPC(Elastic High Performance Computing) 기술은 클라우드에서 실행되는 생명 과학 애플리케이션 및 솔루션, 특히 COVID-19용 CDDD(Computational-Driven-Drug-Design) 및 AIDDD(AI-driven-Drug-Design)를 위한 HPC+AI 플랫폼을 제공하여 연구원들이 연구에만 집중하도록 지원합니다.
사용 사례
글로벌 연구원의 세 가지 사용 사례에서는 COVID-19에 관한 생명 과학 연구에서 Elastic HPC를 직접 활용하거나 GHDDI(Global Health Drug Discovery Institute)의 연구 플랫폼에 접속할 수 있습니다. GHDDI의 의약품 연구 개발 플랫폼은 성공적으로 구축되어 100명 이상의 외부 연구원을 대응하고 있습니다.
본 기술
연구 프로세스를 가속화하기 위해 E-HPC 기술은 RoCE 네트워크 및 GPGPU를 사용하는 고성능 인스턴스와 Gromacs 및 NAMD와 같이 성능에 맞게 조정된 소프트웨어 패키지를 제공합니다. 바이오 제약 연구원은 SSH를 사용하여 클러스터에 로그인하여 직접 연구를 수행할 수 있습니다.
이 E-HPC는 오픈 플랫폼이므로 이 프로그램의 바이오 제약 파트너는 솔루션을 E-HPC 클러스터에 통합하고 솔루션과 컴퓨팅 리소스를 하나로 결합하여 파트너에게 개방할 수 있습니다. 예를 들어, GHDDI(Global Health Drug Discovery Institute)는 '공동 의약품 개발을 통합 데이터 및 AI 시스템' 플랫폼을 구축했습니다. 또한 GHDDI의 연구원은 GHDDI 플랫폼을 통해 E-HPC 클러스터를 사용할 수 있습니다.
관련 제품
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일체형 고성능 퍼블릭 컴퓨팅 서비스를 제공하는 HPCaaS 클라우드 플랫폼.
본 기술
Elastic HPC 기술은 생물 정보학 메타전사체 분석 프로세스를 지원하기 위해 데이터 전송 가속 기능이 있는 병렬 컴퓨팅 클러스터를 제공합니다. E-HPC 서비스는 전산 과정을 통해 원격 유전자 데이터 전송, 압축 해제, 조립, 정렬 및 매핑을 구현합니다.
크로스리전 데이터 전송 가속 기능을 활용하여 공용 데이터베이스의 데이터를 고객의 로컬 컴퓨팅 클러스터로 빠르게 전송할 수 있습니다.
관련 제품
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일체형 고성능 퍼블릭 컴퓨팅 서비스를 제공하는 HPCaaS 클라우드 플랫폼.
본 기술
GHDDI(Global Health Drug Discovery Institute)는 Elastic HPC 기술을 사용하여 코로나19를 위해 특별히 설계된 고성능 약물 발견 전산 시스템을 구축했습니다.
파트너와 함께 GHDDI는 이미 코로나19 약물 발견을 위해 포괄적인 컴퓨팅 노력을 기울였습니다. 이제 GHDDI는 효율성을 극대화하고 중복 작업을 최소화하기 위해 이전의 노력을 기반으로 함께 작업할 전 세계 과학 커뮤니티를 초대합니다.
코로나19 약물 발견 클라우드 컴퓨팅 시스템은 다음을 제공합니다:
• GHDDI 코로나19 데이터 저장소: 항바이러스 약리학 데이터베이스, SARS-CoV-2 표적에 대한 3D 구조 데이터 및 관련된 호스트 타겟 및 상업적으로 이용 가능한 수백만 개의 화합물을 아우르는 가상 화합물 라이브러리.
• 전산 시스템: 훈련된 AI 약물 스크리닝 모델과 Pytorch를 기반으로 완전히 구성된 딥러닝 환경, GOLD와 같은 툴을 사용하는 기존의 가상 스크리닝 시스템, 병렬 처리 기능과 Amber와 같은 생물 물리학 계산 툴이 있는 AutoDock, 도킹 정밀화를 위한 표적 메커니즘 연구 및 자유 에너지 계산을 위한 NAMD.
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공공 연구 기관을 위한 무료 솔루션
COVID-19 연구, 분석 및 퇴치를 돕는 무료 전산 및 AI 플랫폼(“프로그램”)은 COVID-19의 연구 분석 및 예방을 위해 전 세계 공공 연구 기관을 지원하기 위한 것입니다. 연구 프로젝트 요약 및 기술서는 wanqing.hwq@alibaba-inc.com으로 제출할 수 있습니다. 모든 제출물은 기술적인 타당성을 검토하며 자격을 갖춘 지원자들은 별도 연락을 통해 추가 정보 및 다음 단계를 안내 받게 됩니다. 지원서 제출 단계에서 통과되면 지원자는 프로젝트에 따른, 3개월간 유효한 일정량의 쿠폰을 받게 됩니다. 쿠폰으로 HPC, ECS, GPU 등과 같은 Alibaba Cloud 제품을 구매할 수 있습니다. 시중 제품 및 타사 제품 구매는 제외됩니다.
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