RDS MySQL不支持MyISAM引擎的主要原因有如下几个：
MyISAM对数据完整性的保护存在缺陷，且这些缺陷会导致数据库数据的损坏甚至丢失。另外，这些缺陷很多是设计问题，无法在不破坏兼容性的前提下修复。
MyISAM在出现数据损害情况下，很多都需要手工修复，无法适用于产品服务的方式。
对于RDS的存储而言，MyISAM对于I/O的操作不是最优化的方案，导致MyISAM的性能相对于InnoDB的优势不大。
MyISAM向InnoDB的迁移代价低，大多数应用仅需要改动建表的代码即可完成迁移。
MyISAM的发展在向InnoDB转移，在5.7和8.0版本中MySQL可以完全不是MyISAM，系统的数控也被转移到了InnoDB。